免疫沉淀是一种纯化蛋白质的方法。将目的蛋白的抗体与样品提取液孵育，使抗体和蛋白质在溶液中结合。然后用protein A/G 耦合的琼脂糖凝胶，从样品中将抗体/抗原复合物提取出来。这种物理方法可将所需蛋白质从样品中分离。然后样品可以通过SDS-PAGE 进行分离并做 Western

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IHC是应用免疫学基本原理抗原抗体反应，即抗原与抗体特异性结合的原理，通过化学反应使标记抗体的显色剂（荧光素、酶、金属离子、同位素）显色来确定组织细胞内抗原（多肽和蛋白质），对其进行定位、定性及相对定量的研究。

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