随着基因组研究的迅速发展，全基因组测序已逐步成为微生物基础研究的重要手段之一。

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外显子组深度分析能够、较经济地、针对性地对基因区域进行扫描，鉴定外显子上与疾病相关的碱 基变异。

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使用Illumina Genome AnalyzerⅡ对基因组挑选某些特定区域进行测序。节约了测序成本和时间，有助于发现大量个体基因变异、靶向筛选核酸序列等。

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全基因组重测序是对已知参考基因组序列的物种进行不同个体间的基因组测序，并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。应用范围涉及临床医药研究、群体遗传学研究、关联分析、进化分析等众多领域。

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Small RNA 是一类长度18-30nt的非编码RNA，主要包括miRNA、siRNA、piRNA三大类。使用二代测序平台对其进行测序及分析。

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测序可精确到单个碱基的甲基化，能得到全基因组的甲基化位点信息，可用于全基因组DNA甲基化图谱制作;疾病关联分析;基因调控分析;疾病的甲基化标志物等。

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piRNA是一类长度为26～31nt单链的小RNA，大部分集中在29～30nt。piRNA的表达具有组织特异性，只存在于具有全能性的动物细胞，如生殖细胞、肿瘤细胞和干细胞等。

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数字基因表达谱（DGE）是研究某一物种特定组织在特定状态下的基因表达情况，全面、经济、快速地检测不同材料间的差异表达基因。

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单细胞测序是指在单个细胞水平上对基因组/转录组进行扩增与测序的一项新技术。该技术的建立需要两个必备条件:1. 高质量的全基因组/转录组扩增技术2. 高通量低成本的测序技术（Next Generatio

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